WWW.DISSERS.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА

   Добро пожаловать!


Pages:     | 1 |   ...   | 7 | 8 ||

Количество спаренных оснований в оптимальной структуре определяется как максимум функции. Можно минимизировать не число спаренных оснований, а энергию (эта задача сложнее, но ее с помощью разных ухищрений тоже можно оставить кубичной). Минимизация все равно не позволяет достигнуть большой точности предсказания. Проблемы предсказания вторичной структуры РНК связаны с определенными трудностями. Только около 70% тРНК сворачиваются в правильную структуру. Для предсказания вторичной структуры используются энергетические параметры, а они определены не очень точно. Более того, в клетке бывают разные условия, и, соответственно, реализуются разные параметры. Находится единственная структура с минимальной энергией, в то время как обычно существует несколько структур с энергией, близкой к минимальной. Поэтому можно искать субоптимальные структуры и эволюционно консервативные структуры (структуры тРНК и рРНК определены именно так), то есть не абсолютизировать энергетический подход.

Заключение Моделирование глубоко проникает в теоретическое мышление. Важная познавательная функция моделирования состоит в том, чтобы служить импульсом, источником новых теорий. Нередко бывает так, что теория первоначально возникает в виде модели, дающей приближённое, упрощённое объяснение явления, и выступает как первичная рабочая гипотеза, которая может перерасти в предшественницу развитой теории. При этом в процессе моделирования возникают новые идеи и планы эксперимента, происходит открытие ранее неизвестных фактов. Такое «переплетение» теоретического и экспериментального моделирования особенно характерно для развития физических теорий.

Моделирование — не только одно из средств отображения явлений и процессов реального мира, но и — несмотря на описанную выше его относительность — объективный практический критерий проверки истинности наших знаний, осуществляемой непосредственно или с помощью установления их отношения с другой теорией, выступающей в качестве модели, адекватность которой считается практически обоснованной. Применяясь в органическом единстве с другими методами познания, компьютерное моделирование выступает как процесс углубления познания, его движения от относительно бедных информацией моделей к более содержательным моделям, полнее раскрывающим сущность исследуемых явлений действительности.

Компьютерное моделирование находит все большее применение в естественных науках. Оно помогает целенаправленно планировать эксперимент и создавать новые теории.

Литература 1. Акимов О. Е. Естествознание: курс лекций. М.: ЮНИТИ-ДАНА.

2001.

2. Философия: учебник для вузов/Под ред. проф. В.И. Лавриненко, проф. В.П. Ратникова. М.: ЮНИТИ-ДАНА. 2004.

3. Кирпичев М. В. Теория подобия. М.: Из-во АН СССР. 1953.

4. Кочеpгин А.Н. Моделиpoвание мышления М.: Наука. 1969.

5. Веденов А.А. Моделиpование элементов мышления. М.: Наука. 1988.

6. Философский словарь (под ред. М.Т. Фролова) — М.: Политическая литература. 1986.

7. Богомолов А.С. Античная философия. М.: МГУ. 1985.

8. Налимов В. В. Теория эксперимента. М: Наука. 1971.

9. Фpолов И.Т. Гносеологические пpоблемы моделиpования. М.: Наука.

1961.

10. Штофф В.А. Моделиpование и философия. М.: Наука. 1966.

11. Батоpоев К.Б. Кибеpнетика и метод аналогий. М.: ВШ. 1974.

12. Клаус Г. Кибеpнетика и философия. М.: Наука. 1963.

13. Советов Б.Я., Яковлев С.А. Моделирование систем. М.: ВШ. 1998.

14. Сичивица О.М. Методы и формы научного познания. М.: ВШ. 1993.

15. Могилев А.В., Пак Н.И., Хеннер Е.К. Информатика. М.: Академия.

1999.

16. Новик И.Б. О философских вопросах кибернетического моделирования. М.: Знание. 1964.

17. Тарасевич Ю.Ю.Математическое и компьютерное моделирование.

М.:Едиториал УРСС. 2003.

18. Шеннон P. Имитационное моделиpование систем — искусство и наука. М.: Миp. 1978.

19. Дьяконов В.П. Компьютерная математика. Теория и практика. М.:

Нолидж. 2001.

20. Охорзин В.А. Компьютерное моделирование в системе MathCad:

Учебное пособие. М.: Финансы и статистика. 2006. 144 с.

21. В. П. Дьяконов. Справочник по применению системы Derive.

М.: Наука, Физматлит. 1996.

22. Кларк Т. Компьютерная химия. М.: Мир. 1990.

23. Клюев С.А. Взаимодействие между заряженными группами аминокислот и белков// Информационно-вычислительные технологии в решении фундаментальных научных проблем и прикладных задач химии, биологии, фармацевтики, медицины. Москва. ИВТН-2006:

Сборник материалов. С. 17.

24. Клюев С.А. Конформеры карнозина// Биофизика. 2006. Т. 51. Вып.

4. С. 669.

25. Рыжова И.Е., Клюев С.А. Структура и свойства метоксатина // Коршуновские чтения: Сборник научных трудов. Тольятти. ТГУ. 2005.

26. Gill P., Bertolas V., Pretto L., Gill G. Outline of a transition-state Hbond theory // J. Molecular Structure. 2006. Issues. 1-3, P. 40.

27. Урусов В.С., Дубровинский Л.С. ЭВМ – моделирование структуры и свойств минералов. М.: Изд-во МГУ, 1989.

28. Урусов В.С. Как кристаллохимия предсказывает структуру и свойства кристаллов // Соросовский образовательный журнал. 1997. N.

12. С. 41.

29. Шайтан К.В. Каким образом электрон движется по белку // Соросовский образовательный журнал. 1999. N. 3. С. 55.

30. Клюев С.А. Окислительно-восстановительные процессы при неблагоприятной разности стандартных потенциалов // Журнал физической химии. 1993. Т. 67. N. 9. C. 1926.

31. Клюев С.А. Вольтамперометрическое изучение адсорбированного ферредоксина I // Биофизика. 2003. Т. 48. Вып. 3. С. 400.

32. Болондинский В.К., Кайбияйнен Л.К. Исследование световых кривых фотосинтеза у сосны обыкновенной в ходе вегетации // Вестник Башкирского университета. 2001. № 2 (I). С. 13.

33. Уотерман Р.Д., Ленат Д., Хейсе-Рот Ф. Построение экспертных систем. М.: Мир. 1987.

34. Таунсенд К., Фохт Д. Проектирование и программная реализация экспертных систем на персональных ЭВМ. М.: Финансы и статистика.

1990.

35. Острейковский В.А. Информатика. Учеб. для вузов. М.: Высшая школа. 2000.

Pages:     | 1 |   ...   | 7 | 8 ||






© 2011 www.dissers.ru - «Бесплатная электронная библиотека»

Материалы этого сайта размещены для ознакомления, все права принадлежат их авторам.
Если Вы не согласны с тем, что Ваш материал размещён на этом сайте, пожалуйста, напишите нам, мы в течении 1-2 рабочих дней удалим его.